答案是不，凤九和东华并没有在故事中死去。
这部作品以其细腻的情感描绘和丰富的故事情节赢得了广大读者的喜爱。凤九与东华之间的情感纠葛、三生三世的情缘，构成了故事的主线。尽管在故事中经历了许多磨难和考验，但最终他们并没有走向悲剧的结局。
在故事的最后阶段，凤九与东华终于走到了一起，克服了各种阻碍，也抵挡住了许多命运的考验。虽然他们在实现彼此爱情的过程中，也曾饱受苦难和挣扎，但他们的坚持与信念最终获得了回报。他们之间的感情故事成为了故事中最引人入胜的部分，也为整个故事画上了一个完美的句号。
所以，凤九和东华并没有在《三生三世枕上书》中死去，他们最终收获了幸福的结局。这一结果也符合了大多数观众对于美好结局的期待。